Проект реставрации здания театра был разработан группой архитекторов во главе с президентом Союза архитекторов России Андреем Боковым. Проект предполагает реставрацию главного усадебного дома, а также строительство нового зрительного зала в виде амфитеатра с трансформируемой сценой и оркестровой ямой. В результате театр приобретет комплекс из двух залов: старого студийного на 200 мест и нового — на 480. Общая площадь обновленного здания «Геликон-оперы» составит 11 460 кв. м, этажность — 3-4 этажа.
Реставрационные работы на объекте начались в 2008 году. Однако затем строительство долгое время было заморожено в связи со сменой подрядной организации. В декабре прошлого года были проведены торги по выбору подрядчика, победителем которых стал ООО «Научно-производственное объединение «Космос», с которым заключен государственный контракт.
В настоящее время, по данным Управления надзора по ЦАО Мосгосстройнадзора, на объекте ведутся работы по устройству распорной системы и разработке котлована.